Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LRRTM2O43300 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRTM2O43300 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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