Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBDO15205 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBDO15205 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBDO15205 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBDO15205 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBDO15205 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBDO15205 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBDO15205 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBDO15205 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBDO15205 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBDO15205 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBDO15205 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBDO15205 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UBDO15205 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UBDO15205 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBDO15205 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UBDO15205 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UBDO15205 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UBDO15205 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBDO15205 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBDO15205 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBDO15205 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UBDO15205 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBDO15205 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBDO15205 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBDO15205 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBDO15205 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBDO15205 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBDO15205 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBDO15205 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBDO15205 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBDO15205 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBDO15205 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBDO15205 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBDO15205 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBDO15205 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBDO15205 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBDO15205 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBDO15205 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UBDO15205 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBDO15205 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBDO15205 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBDO15205 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBDO15205 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBDO15205 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBDO15205 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UBDO15205 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UBDO15205 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBDO15205 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBDO15205 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UBDO15205 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UBDO15205 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UBDO15205 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBDO15205 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBDO15205 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBDO15205 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBDO15205 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBDO15205 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBDO15205 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBDO15205 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBDO15205 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBDO15205 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBDO15205 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBDO15205 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBDO15205 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBDO15205 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBDO15205 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBDO15205 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBDO15205 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBDO15205 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBDO15205 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBDO15205 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBDO15205 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBDO15205 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBDO15205 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBDO15205 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBDO15205 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBDO15205 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBDO15205 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBDO15205 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms