Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DFFAO00273 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DFFAO00273 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DFFAO00273 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DFFAO00273 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DFFAO00273 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DFFAO00273 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DFFAO00273 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DFFAO00273 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DFFAO00273 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
DFFAO00273 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DFFAO00273 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DFFAO00273 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DFFAO00273 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DFFAO00273 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DFFAO00273 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DFFAO00273 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DFFAO00273 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DFFAO00273 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DFFAO00273 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DFFAO00273 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DFFAO00273 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DFFAO00273 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DFFAO00273 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DFFAO00273 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
DFFAO00273 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DFFAO00273 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DFFAO00273 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DFFAO00273 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DFFAO00273 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms