Protein–RNA interactions for Protein: K7ERE1

TMEM256-PLSCR3, TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms