Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF879B4DU55 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms