Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC160A6NGH7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC160A6NGH7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms