Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC9Q9Y397 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms