Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KDM2AQ9Y2K7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM2AQ9Y2K7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms