Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RCE1Q9Y256 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms