Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SHOC2Q9UQ13 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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