Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTF2Q9UNY4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTF2Q9UNY4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms