Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFSF18Q9UNG2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNFSF18Q9UNG2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNFSF18Q9UNG2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNFSF18Q9UNG2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNFSF18Q9UNG2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNFSF18Q9UNG2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNFSF18Q9UNG2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNFSF18Q9UNG2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNFSF18Q9UNG2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNFSF18Q9UNG2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms