Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCML1Q9UN30 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms