Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKLN1Q9UL63 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms