Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPC1L1Q9UHC9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms