Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms