Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CFDP1Q9UEE9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.3 ms