Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM8

MGAT4C, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase C, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4CQ9UBM8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGAT4CQ9UBM8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms