Protein–RNA interactions for Protein: Q9P270

SLAIN2, SLAIN motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAIN2Q9P270 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLAIN2Q9P270 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms