Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
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