Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VNN3Q9NY84 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms