Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.33■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3EQ9NVU0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms