Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMBRD1Q9NUN5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms