Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC4Q9NTJ3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC4Q9NTJ3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms