Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A13Q9NSD5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms