Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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