Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTPS2Q9NRF8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms