Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms