Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP4F12Q9HCS2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F12Q9HCS2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms