Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms