Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLMPQ9H6B4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms