Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms