Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM5Q9C035 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM5Q9C035 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM5Q9C035 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM5Q9C035 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM5Q9C035 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM5Q9C035 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM5Q9C035 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM5Q9C035 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM5Q9C035 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM5Q9C035 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM5Q9C035 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM5Q9C035 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM5Q9C035 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM5Q9C035 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms