Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms