Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RSPO3Q9BXY4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RSPO3Q9BXY4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RSPO3Q9BXY4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RSPO3Q9BXY4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RSPO3Q9BXY4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSPO3Q9BXY4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms