Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SNHG12Q9BXW3 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms