Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GINS3Q9BRX5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms