Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMSS1Q9BQ75 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CMSS1Q9BQ75 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CMSS1Q9BQ75 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CMSS1Q9BQ75 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CMSS1Q9BQ75 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CMSS1Q9BQ75 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CMSS1Q9BQ75 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMSS1Q9BQ75 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CMSS1Q9BQ75 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms