Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SMIM7Q9BQ49 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms