Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HHIPQ96QV1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms