Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARXQ96QS3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms