Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms