Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SAMD8Q96LT4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD8Q96LT4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SAMD8Q96LT4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SAMD8Q96LT4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SAMD8Q96LT4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SAMD8Q96LT4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SAMD8Q96LT4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SAMD8Q96LT4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SAMD8Q96LT4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SAMD8Q96LT4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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