Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms