Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC136Q96JN2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC136Q96JN2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms