Protein–RNA interactions for Protein: Q96HW7

INTS4, Integrator complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS4Q96HW7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
INTS4Q96HW7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
INTS4Q96HW7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms