Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTV1Q96GA3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms