Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms