Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF3C6Q969F1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms