Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms